El coronavirus se diagnostica sobre la base de los síntomas típicos, el contacto con algún contagiado y con una prueba positiva. Según los médicos búlgaros de primera línea, sin embargo, la práctica resulta un poco más distinta. En 2 ó 3 casos, a pesar del cuadro clínico típico de Covid−19, probado además por los análisis radiográficos, las pruebas PCR de los pacientes salen negativas. Los expertos explican el fenómeno con la calidad del secreto que se analiza, siendo más fidedigno el que se haya tomado de los pulmones. Según el Dr. Anguel Kunchev, inspector sanitario principal del Estado, la probabilidad de falsos negativos en la prueba PCR es del 3 al 5%. Por eso considera que de estar presentes los síntomas y de saberse el origen del contagio, sí se puede poner el diagnóstico de coronavirus no obstante el test negativo.
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