Браншови организации в хранителната промишленост смятат, че Агенцията по храните не изпълнява функциите, за които е създадена и настояват тя да излезе от структурата на Министерството на земеделието и храните.
Светла Чамбова от Асоциацията на месопреработвателите изтъкна:
Видя се за две години, че Агенцията по храните има проблеми. Моето предложение е: Агенцията по безопасност на храните да е надведомствена, да се спре с поръчковото законодателство. Седи ли Агенцията в рамките на едно министерство - те си правят закони, те си правят наредби и тези, които правят наредбите, след това ги изпълняват. Такова нещо няма никъде в света.
Според заместник-министъра на земеделието Явор Гечев въпросът е не на чие подчинение е, а как работи агенцията.
Всички хранителни браншове застават зад идеята, че Законът за храните трябва да се промени. Да не се пълни с евронорми, които така или иначе са задължителни, а да е регламент, които гарантира липса на излишен чиновнически натиск върху производителите. Чамбова допълни:
Нов закон за храните, в който да не влиза никакъв текст от европейското законодателство, задължително за прилагане, а да влизат само специфичните неща за България.