Израелският премиер Бенямин Нетаняху заяви, че критиките по адрес на операцията на израелската армия срещу хуманитарната флотилия са "международно лицемерие." Нетаняху подчерта, че конвоят от кораби е имал за цел не доставянето на хуманитарни помощи за Газа, а разбиването на израелската блокада. Активистите са били въоръжени и враждебни, затова израелските войници са действали в своя защита.
"Израел отново е изправен пред лицемерие и пристрастни, прибързани заключения. Хамас прекарва нелегално хиляди ирански ракети, бомби и други оръжия. Прекарва ги нелегално в Газа, за да ги изстрелва срещу израелските градове. Според международните закони, здравия разум и благоразумието, Израел има пълното право да конфискува това оръжие и да инспектира корабите, които вероятно го превозват. Израел съжалява за жертвите, но никога няма да се извиним, че се защитаваме," подчерта Нетаняху.
ООН, Европейският съюз и редица други страни разкритикуваха действията на израелските командоси, но най-острите критики дойдоха от Турция - единственият съюзник на Израел в мюсюлманския свят.