Кризата с мигрантите остава един от най-сложните проблеми пред Европейския съюз. Според Йотова, неуспехът на политиката в тази област се дължи на това, че Европа е загубила лидерските си позиции във външнополитически план:
"Не виждам финализирането на реформите по Дъблинския регламент и до края на българското председателство. Най-вероятно той ще бъде прехвърлен след нас, по време на председателството на Австрия".
Йотова подкрепя идеята за европейска система за отбрана:
"Това не означава конфликтна точка с НАТО. Напротив. Това не трябва да бъдат два конкуриращи се съюза, а по-скоро допълващи се, за да се осигури онази защита и сигурност на европейските граждани, към която се стремим".