След приключване на мандата създава фондация "Доктор Желю Желев", автор е на десетки книги и носител на държавни престижни отличия.
Д-р Желев е председател на Балканския политически клуб, основан на 26-и май 2001-ва година по негова идея. В Учредителното събрание под мотото "Да европеизираме Балканите" тогава участват президентите Йон Илиеску, Сюлейман Демирел, Емил Константинеску, Киро Глигоров, политически лидери от Босна и Херцеговина, Гърция, Албания, Македония, Турция.
Само преди три дни д-р Желев участва в Съвета на президентите заедно с Росен Плевнелиев, Петър Стоянов и Георги Първанов.
Звукова картина от митинга на 10-и декември 1989-а година и част от речта на президента Желев по време на икономическата криза можете да чуете в звуковия файл.
Министър-председателят Бойко Борисов съобщи, че правителството и президентството ще подготвят държавно погребение за президента Желю Желев . С думите Господ прибира първо добрите хора премиерът изказа съболезнования на близките на Желев...
Министерският съвет обяви 1 февруари 2015 г. (неделя) за ден на национален траур по повод кончината на Президента на Република България д-р Желю Желев (1990-1997 г.). В негова памет националните флагове на държавните институции ще бъдат свалени наполовина...